type
status
date
slug
summary
tags
category
icon
password
Property
Feb 6, 2024 08:01 AM
URL
先看效果:
- 分子同步转动，省去手动调节每个分子
- 排版一键完成，并且保存高清图片
- ppt 演讲的时候如果条件允许可以直接用 Mathematica 笔记本将更加清晰
1. 需求
在化学反应研究中，最高占据分子轨道（HOMO）和最低未占据分子轨道（LUMO）的理解和分析至关重要。传统上，我们依赖 Gaussian09/16 软件来计算这些轨道数据，这一过程涉及将计算结果的 chk 文件通过 formchk 命令转换为 fchk 文件，再使用 cubegen 命令将 fchk 文件转化为 cube 文件，最后能进行可视化处理。
然而，这一流程并不尽如人意，尤其是在需要同时处理多个分子的轨道数据时。每当需要统一调整多个分子的视角以保持一致性时，工作量急剧增加，手动调整变得异常繁琐。此外，完成这些步骤后，我们还需进行复杂的图像排版工作，这在处理大量分子时更是耗时耗力。
2. 解决
面对这些繁琐且耗时的步骤，我想到了一个高效且简洁的解决方案：结合 Mathematica 和 Gaussian 16，实现一键式分子轨道可视化和自动排版。
首先，我们继续利用 Gaussian 16 进行精确的轨道数据计算。接着，借助 Mathematica 强大的数据处理和图形展示能力，将这些复杂的数据转换成直观的3D图像。这一过程不仅简化了数据转换，还提高了整体的工作效率
接着我们在 PowerPoint 里面做好 ppt 模板，然后将这些图片直接拖入，免去每次都需要排班的麻烦
2.1 表格代码
代码
2.2 HOMO，LUMO 函数
代码
3. 其他
使用 Mathematica 还有一个好处就是,无需每次都重新打开重新载入,因为一旦运行成功后,以后每次打开都能自己随意调整视角什么的,同时还能做其他的数据分析,偶极矩,发光光色,弗朗克-康登原理,分子静电式的可视化和排版等等
- 作者:我心永恒
- 链接:https://wxyhgk.com/article/mma-g16-homolumo
- 声明:本文采用 CC BY-NC-SA 4.0 许可协议，转载请注明出处。
